Pohjois-Karjalan museo taltioi kokoelmiinsa esineitä ja valokuvia omasta maakunnasta sekä Laatokan Karjalasta. Esine- ja kuvakokoelmat muodostavat museon perustan. Kokoelmia hyödynnetään museon näyttely-, julkaisu- ja opetustoiminnassa. Museo ottaa vastaan esine- ja kuvalahjoituksia tallennustoiminnan valintaperusteiden mukaisesti (ohjeita lahjoittajille). Pohjois-Karjalan museon valokuva-arkisto on avoin kaikille asiakkaille. Esinekokoelmia lainataan pääasiassa ammatillisesti hoidetuille museoille.

Kokoelmien säilymisen turvaaminen on museon tärkeä tehtävä. Museohenkilökunta huolehtii kokoelmien asianmukaisesta säilytyksestä ja käsittelystä. Esineiden ja valokuvien dokumentointi on välttämätön perustehtävä. Sen ansiosta kokoelmat ovat paremmin museon ja sen asiakkaiden käytettävissä.