Aivan nykyisen Jänisjärven koillisimmassa nurkassa on Pioneerileirin asuinpaikka. Sieltä löytyy viitteitä asutuksesta ajalta, jolloin ensimmäiset saviastiat otettiin käyttöön. Sortuvalta vanhalta rantaterassilta löytyi vanhinta kampakeramiikkaa, jota ryhdyttiin valmistamaan ja käyttämään Suomessa ja Venäjän Karjalassa vuoden 5000 eKr. tienoilla.

Vajaa puoli kilometriä Pioneerileirin asuinpaikalta etelään sijaitsee toinen tunnettu neoliittisen kivikauden asuinpaikka. Täällä, Kakunkylän Kesämaassa, apteekkari Helpeen kesämökkitontilla, suoritettiin kaivaukset 1930-luvulla. Tutkimuksissa paljastui, että asuinpaikalla oli sijainnut neoliittinen talo, jollaisia muun muassa Suur-Saimaan alueella tuohon aikaan rakennettiin. Kesämaan saviastian palaset ajoittavat asutuksen hieman Pioneerileirin asutusta nuoremmaksi.

Jänisjoen reitin latvoilla neoliittinen kivikausi näyttää hiljaiselolta varhaisempiin aikoihin nähden. Reitin pohjoisosista, lähinnä Loitimojärven rannoilta, on löytynyt viitteitä neoliittisesta toiminnasta. Löytyneet kiviesineet on kuitenkin satunnaisempi kulkijakin saattanut hukata.